Az új Felhasználó kezelő a webhely elérését vezérli. A hozzáférési csoportokat hagyhatjuk úgy, ahogy az a Joomla 1.6 verzióval érkezik, de tehetjük összetettebbé is. További információk találunk a hozzáférés vezérléséről a Joomla! dokumentációs webhelyen.
A Joomla 1.5 és 1.0 verzióban a tartalom szekciókba és kategóriákba volt szervezve. A 1.6 verzióban a szekciók eltűntek és kategóriákat hozhatunk létre kategóriákon belül tetszőleges mélységig. A példaadatok sok példát mutatnak be az egymásbaágyazott kategóriák használatáról.
A jobb használhatóság és a rugalmasság kedvéért minden elrendezést átterveztek. Ha szeretnénk megtartani a 1.5 verzió elrendezéseit, akkor azokat a MilkyWay sablon html könyvtárában találjuk. Ezeket egyszerűen át kell másolni a sablonunk html könyvtárába.
A telepítő továbbfejlesztésének köszönhetően a webhely és a bővítményekt frissítése könnyebb, mint valaha.